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單細胞全基因組重測序碧云天NGS測序 應用于基因/測序信息二維碼

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單細胞全基因組重測序
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碧云天高通量測序服務詢價表

服務編號服務名稱全額預付特價(元)半額預付特價(元)零首付價(元)備注
T0731RNA抽提、質(zhì)檢250元/樣品290元/樣品320元/樣品適用于凍存的細胞、組織樣品等
T0732特殊RNA抽提、質(zhì)檢300元/樣品350元/樣品380元/樣品適用于全血、FFPE切片
T0736DNA/RNA質(zhì)檢100元/樣品130元/樣品150元/樣品首次免費,首次質(zhì)檢如果不合格后續(xù)檢測收費
T0738文庫質(zhì)檢(Qubit法)200元/樣品250元/樣品280元/樣品Qubit文庫質(zhì)檢,適用于絕大多數(shù)文庫
T0739文庫質(zhì)檢(qPCR法)1100元起1200元起1300元起qPCR質(zhì)檢比Qubit精度更高,25個文庫為一批,首個文庫按表中價格收費,后面的24個文庫每個只收110元

注:以上樣品制備與質(zhì)檢技術服務項目僅作為高通量測序的配套服務,不單獨提供相應服務。


碧云天高通量測序技術服務詢價與訂購:

  1. 請您下載并填寫《 碧云天高通量測序服務詢價表》,發(fā)送至ngs@beyotime.com,我們將為您設計最佳方案。

  2. 若有訂購意向,碧云天的高通量測序技術服務人員會與您聯(lián)系,并簽訂《碧云天高通量測序技術服務協(xié)議書》。

  3. 送樣時,請下載并填寫《碧云天高通量測序生物樣品信息表》,發(fā)送至ngs@beyotime.com或碧云天高通量測序技術服務人員郵箱。樣品的具體要求參見《碧云天高通量測序生物送樣要求》。

碧云天高通量測序技術服務優(yōu)勢:

  1. 技術經(jīng)驗豐富:碧云天擁有強大的技術團隊,具有多年的核酸純化試劑盒開發(fā)經(jīng)驗,在核酸樣品處理方面有豐富的操作經(jīng)驗。

  2. 分析能力強:碧云天有專業(yè)的生物信息分析團隊,為您提供完善的分析服務。

  3. 服務全面快速:碧云天有多年的試劑研發(fā)經(jīng)驗,有完備的分子生物學產(chǎn)品線和完善的生物技術服務體系,可為您后繼實驗提供跟蹤服務。另外,我們承諾以最快的速度去解決您遇到的問題。

  4. 實驗平臺靈活:碧云天現(xiàn)在主要利用主流的Illumina平臺為主,可以根據(jù)實驗目的和要求靈活運用不同的實驗平臺的優(yōu)勢。

  5. 性價比高:碧云天以最優(yōu)惠的價格為您提供最全面的服務,幫助您有效節(jié)約實驗成本。

碧云天高通量測序技術服務客戶須知:

  1. 樣品寄出前,請給ngs@beyotime.com或碧云天高通量測序技術服務人員郵箱發(fā)送一份填寫完整的電子版《碧云天高通量測序生物樣品信息表》;如有特殊情況,請在快遞發(fā)出前與碧云天高通量測序技術服務人員電話聯(lián)系,比如客戶自送樣品、提前寄送樣品、有其它物品隨樣品一起快遞需要額外點收等,以便安排人手,防止丟失。

  2. 請將填寫完整的紙質(zhì)版《碧云天高通量測序生物樣品信息表》以及其它技術資料(如有)密封于塑料袋內(nèi),隨樣品一起寄出;協(xié)議書和硬盤(數(shù)據(jù)量較大,需硬盤存儲)請另單快遞給對應接收人員,不要與樣品一起快遞,既避免物流分揀環(huán)節(jié)導致合同和硬盤遺失,也避免干冰或藍冰冷凝水可能損壞文件和硬盤。

  3. 如果需要進行生物信息學分析,請在《碧云天高通量測序生物樣品信息表》的“項目描述”欄目里注明。

  4. 樣品置于1.5ml或其它型號的低吸附離心管里;管上清楚標明樣品名稱,樣品管上的名稱要與《碧云天高通量測序生物樣品信息表》一致,請雙人核實無誤;用parafilm膜把樣品管纏緊密封好;將樣品管置于保護用的50ml離心管或其它容器里,用適量紙、紗布或棉花塞緊,防止樣品管晃蕩,旋緊蓋子。

  5. 根據(jù)樣品類型選擇室溫、藍冰或者干冰包裝,選擇最快的運輸方式以免樣品降解;合理安排發(fā)貨時間,避免周六、周日或法定節(jié)假日到達,以免樣品丟失。低溫運輸采用安全的干冰,不要用危險的液氮;液氮如果滲進樣品管,在溫度發(fā)生變化時因體積膨脹有可能導致爆炸,毀壞樣品。

  6. 項目結束后,剩余樣品免費保存6個月;如果需要延長保存期或者返還,請?zhí)崆芭c碧云天高通量測序技術服務人員聯(lián)系。

  7. 其它詳細的樣品要求請見《碧云天高通量測序生物送樣要求》。


碧云天單細胞全基因組重測序技術服務項目明細:

單細胞全基因組重測序:是指運用全基因組擴增技術對單個細胞的基因組進行擴增并進行全基因組測序,并在細胞水平進行差異性分析的研究方法。對單個細胞基因組進行擴增該技術解決了基因組擴增對微量初始模板過大的擴增偏倚,使基因組測序的模板需求量從μg級降至單細胞水平。


技術流程
MALBAC擴增原理技術優(yōu)勢

  1. 運用MALBAC多重退火環(huán)狀循環(huán)擴增技術,解決了基因組擴增對微量初始模板過大的擴增偏倚,使得單細胞中90%的基因組能夠被測序,樣品起始量可低至0.5pg

  2. 通量高:每個樣本可達30X以上的數(shù)據(jù)產(chǎn)出量,海量數(shù)據(jù)用于分析

  3. 覆蓋度高:能檢測到大于90%的SNP

  4. 分辨率高:單堿基分辨率

  5. 可檢測到基因組內(nèi)較大的結構性變異及基因拷貝數(shù)變化等

  6. 可全面發(fā)掘新的和稀有的遺傳變異

  7. 更加全面、可靠的基因變異信息

  8. 數(shù)據(jù)偏差小、高均一性,真實反應樣本基因組信息


技術參數(shù)

測序平臺與方式:HiSeq, PE150
測序數(shù)據(jù)量:建議90Gb/樣本
測序及基礎分析周期:1G以下基因組,樣品量小于10個,每個樣品不超過10X基因組測序深度,標準流程的執(zhí)行周期約為20個工作日;樣品數(shù)量多于10個時,項目的執(zhí)行周期需根據(jù)項目的規(guī)模而定


樣品要求

  1. 樣品類型: 已分離的單細胞樣本或DNA 樣品

  2. 樣品需求量(單次): 樣品建議為單細胞或DNA總量≥10pg


數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

    標準信息分析
  1. 數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計及堿基質(zhì)量評估

  2. 去除低質(zhì)量、污染及接頭序列

  3. 比對(測序深度及覆蓋度等分析)

  4. 一致性序列生成

  5. 高級信息分析
  • SNV/Indel對應基因突變高級功能注釋(dbSNP, clinvar, HGMD, cosmic, 1000gemome, EAS, Pubmed等)

  • CNV檢測(5M)


應用案例

全基因組范圍檢測人單細胞中單核苷酸和拷貝數(shù)變異
Chenghang Zong, Sijia Lu, Alec R. Chapman, and X. Sunney Xie. Genome-Wide Detection of Single Nucleotide and Copy Number Variations of a Single Human Cell. Science. 2012 December 21; 338(6114): 1622–1626.

由于DNA的動態(tài)變化,同類細胞的基因組可能會有差別。這種基因組的差別需要通過單細胞測序來檢測到,但由于基因擴增中有偏向性,導致基因組覆蓋度很低。有一種新擴增技術:多重退火環(huán)狀循環(huán)擴增技術(MALBAC) 可以克服這個難題,并得到覆蓋度很一致的測序結果。MALBAC擴增技術在對單個人細胞做平均25X測序時,可以達到93% 大于1x 的覆蓋度。 對單個腫瘤細胞進行CNV檢測,并通過三個同類細胞的測序, 可檢測到單個的SNV,并且沒有假陽性。在全基因組范圍對癌細胞系的突變率進行統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)嘌呤-嘧啶的顛換在新獲得的SNV中異常頻繁。

單個腫瘤細胞中的拷貝數(shù)變異 (CNVs)


單細胞全基因組重測序是指運用全基因組擴增技術對單個細胞的基因組進行擴增并進行全基因組測序,并在細胞水平進行差異性分析的研究方法。由美國科學院院士、哈佛教授發(fā)明的MALBAC? (Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles)技術,對單個細胞基因組進行擴增該技術解決了基因組擴增對微量初始模板過大的擴增偏倚,使基因組測序的模板需求量從μg級降至單細胞水平,使得單細胞中90%的基因組能夠被測序,為微生物生態(tài)學、癌癥基因組、法醫(yī)學、微量診斷、遺傳印記等研究打開了一扇新的大門。


碧云天高通量測序與數(shù)據(jù)分析技術服務項目表:

服務編號服務名稱服務時間全額預付特價(元)半額預付特價(元)零首付價(元)服務內(nèi)容交付結果
T0741單細胞全基因組重測序以及標準分析25-30個工作日119001260014000單細胞擴增全基因組重測序,PE150,90Gb數(shù)據(jù),包含標準基礎分析原始數(shù)據(jù)(序列文件*.fastq)及分析報告
T0730高級分析與個性化分析據(jù)項目要求定詢價詢價詢價據(jù)項目要求定,請?zhí)崆昂捅淘铺祉椖控撠熑藴贤?/td>分析報告

備注:質(zhì)檢首次免費,如果樣品首次質(zhì)檢不通過,后續(xù)再進行質(zhì)檢每樣加收100元。核酸抽提與質(zhì)檢、自制文庫質(zhì)檢以及數(shù)據(jù)分析報價如下。


碧云天高通量測序樣品制備與質(zhì)檢技術服務項目表:

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單細胞全基因組重測序碧云天NGS測序 應用于基因/測序,單細胞全基因組重測序

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單細胞全基因組重測序碧云天NGS測序 應用于基因/測序信息由 上海碧云天生物技術有限公司為您提供,如您想了解更多關于單細胞全基因組重測序碧云天NGS測序 應用于基因/測序報價、型號、參數(shù)等信息,歡迎來電或留言咨詢。

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注:該產(chǎn)品未在中華人民共和國食品藥品監(jiān)督管理部門申請醫(yī)療器械注冊和備案,不可用于臨床診斷或治療等相關用途

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