美國應用生物系統(tǒng)公司StepOne實時PCR擴增儀配備的軟件在Windows XP操作系統(tǒng)上運行，并提供儀器控制、數(shù)據(jù)采集和數(shù)據(jù)分析等功能。軟件采用用戶易用的直觀界面，包括以下功能：
實驗設計向?qū)?，幫助設計和設置實驗；
移液方案和配方，用于快速設置實驗；
高級設置，適用于需要靈活性以便進行更復雜應用（如多重反應）的高級用戶；
快速啟動設置，允許您立即啟動實驗并于稍后設置反應板信息；
實時監(jiān)視擴增增長曲線，讓您即時查看實驗進程；
遠程實時監(jiān)控，可從一臺遠程計算機監(jiān)控實驗進程；
電子郵件通知，在實驗已開始或結束時提醒您；
自動基線和自動閾值功能令數(shù)據(jù)分析得以簡化；
自動單核苷酸多態(tài)性基因分型識別功能，具有直觀的圖表輸出和量值分配特性；
工具提示功能，當查看擴增曲線或單核苷酸多態(tài)性基因分析圖譜時，易于識別樣本反應孔；
故障排除標記，幫助您診斷并解決實驗中出現(xiàn)的問題；
多圖譜視圖，可同時從四個透視圖數(shù)據(jù)；
簡便的剪切和粘貼功能。